植物代谢组学研究:初生/次生代谢、取样策略与 LC-MS 分析要点-蛋白相关服务 -技术服务-生物在线
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植物代谢组学研究:初生/次生代谢、取样策略与 LC-MS 分析要点

植物代谢组学研究:初生/次生代谢、取样策略与 LC-MS 分析要点

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产品名称: 植物代谢组学研究:初生/次生代谢、取样策略与 LC-MS 分析要点

英文名称: Plant Metabolomics Research: Primary and Secondary Metabolism, Sampling Strategies and LC-MS Analysis

产品编号: plant-metabolomics-research-guide

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产品产地: 中国北京

品牌商标: 百泰派克生物科技

更新时间: 2026-07-11T11:03:34

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封面:叶片与代谢分子网络

 

植物代谢组学在同一株植物上同时面对极高化学多样性:糖酸、氨基酸、生物碱、萜类、酚酸、类黄酮等往往共现于一次提取液。研究问题决定关注初生代谢通路(碳氮流、能量)还是次生代谢(抗逆、品质、药用成分)——两者前处理与色谱体系并不总是可一套到底。

 

关键挑战

主题 实操提示
空间异质性 根/叶/果皮分取,减少「整株糊样」
昼夜与年龄 时间点写进实验记录,利于解释波动
多酚色素 SPE/基质分散或梯度优化以降低离子抑制

 

器官与时间:植物代谢变异的主要来源

图 1. 先于统计模型之前,生物学上的重复应从同一种植批次、同一处理方式讲起。

 

LC-MS/MS 路线的典型切分

非靶向图谱用于刻画表型漂移;若在育种或炮制工艺里盯住少数标志物,可切换靶向 MRM提高批次重现性。挥发性萜类往往需要 GC 或互补方案——不要默认一种液质包住全部类别。

 

从粗提物到解释的简化流程(示意)

图 2. 提取一致性常与色谱表现等价重要;换新溶剂要重新建立 QC。

 

应用场景

作物逆境、药食同源素材评价、宿主‑微生物共生界面、次级代谢通路挖掘等皆可纳入统一框架:先定性谱再回落到生理学假设。

 

研究与产业问题的快速映射

图 3. 科研选题与质量控制深度应相匹配——发表级发现通常需要多块独立田间或温室重复。

 

FAQ

1、速冻必须吗?

绝大多数初级与次级代谢瞬时响应建议液氮猝灭。

 

2、可以同时测 polar 与 lipid 吗?

常需分馏或双管齐下两套方法。

 

3、如何做品种比较?

控制土壤、光照、浇水与取样时刻,才能把遗传效应从环境噪声分离。

 

结论

植物样品的复杂度来自组织结构 + 次生化学多样性 + 外部环境。把器官的物理边界与色谱化学边界同时设计好,植物代谢组学才能稳定地产出可复述的差异谱与通路故事。

 

百泰派克生物科技特色项目

 

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析,N端测序,C端测序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。

 

※服务优势:

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug,即可完成检测;

6.测序不受N端封闭,PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

 

 

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

 

※服务优势:

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法,适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高,实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白,线性范围广;

5.专业生物信息学分析,分析更系统准确。

 

 

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析,采用金属元素标记物(通常是金属元素标记的特异抗体)标记细胞表面和内部的分子,然后用流式细胞原理分离单个细胞,再用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)分析单个细胞的原子质量谱,最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

 

※服务优势:

1.技术先进,填补技术空白

采用金属标记抗体技术,避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征,百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大,成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制,所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右,而流式质谱技术一次(单样本)就可分析至少10^5的细胞,实现了数量级的提高,且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化,在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景;

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外,质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰;

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

 

 

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析,可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究,旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案,深入挖掘未知的靶标。

 

 

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术,MALDI TOF,高效色谱分离技术,提供一系列完善的生物药物分析方案,从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析,到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务,帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

 

 

百泰派克生物科技七大检测平台

 

 

 

百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务;

2.获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务;

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;

4.七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;

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6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

 

 

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